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至今为止，直肠息肉的发病原因繁杂多变，根据临床诊断发现，其发病可能主要与下列因素有关。
1、组织结构异常 如幼年性息肉，即属错构瘤性息肉。
2、基因遗传 如家族性腺瘤性息肉病是由常染色体显形遗传。病人常有家族性发病史。
3、感染 部分息肉可由细菌、寄生虫等感染直肠黏膜，由肠道炎性病变增生而致息肉。如肠结核、肠血吸虫病、溃疡性结肠炎等。
（二）发病机制：
1、分类：病理上常将息肉分为2类：肿瘤性息肉和非肿瘤性息肉。
2、病理：
（1）管状腺瘤：最为常见，多数是单个，有蒂，直径一般在1cm以下，在肠黏膜表面隆起如米粒或黄豆大，表面光滑或呈细颗粒，颜色接近正常黏膜，质软；大腺瘤如樱桃或草莓，表面有浅沟或分叶状，色暗红，很少癌变。镜下形态可有不同程度改变，轻者为轻度腺体增多，上皮细胞无异常，重者不仅腺体明显增生，上皮细胞的形态及染色也呈不典型改变，核分裂增多，进一步发展出现腺体细胞多形性，间质浸润，即被认为是重度不典型增生或癌变。
（2）绒毛状腺瘤：又称乳头状腺瘤，呈绒毛状、菜花状突出于黏膜表面，病变范围限于黏膜层，瘤体质地柔软，广基无蒂，体积较管状腺瘤大，镜下绒毛状突起呈分支状，形成一个细长乳头状花冠肿物。多见于老年人，男性多于女性，约90%发生在直肠和乙状结肠下段，易癌变。
（3）幼年性息肉：又称先天性息肉，属错构瘤性息肉，主要发生在10岁以下儿童，有70%～80%发生在直肠，多为单发，小于1cm，青春期后有自然消失倾向。
（4）炎性息肉（假性息肉）：发生在大肠炎性疾病的再生与修复阶段，多见于溃疡性结肠炎、Crohn病、肠结核、血吸虫病等。常为多发，无蒂、体积较小，直径很少超过5mm，是其特征，颜色多较浅。有的亦可以有蒂，病程较长时可增大至几厘米。镜下见腺体变长伴有腺腔内反折，形成锯齿样外观。核分裂活性增加仅仅见于基底部，上皮细胞具有不明显的位于基底的细胞核、胞浆丰富，充满黏液。表面上皮下的基底膜增厚，表面上皮呈微乳头外观。增生性息肉（化生性息肉），多发生在直肠，多在40岁以后发病，随年龄增长，发病率增加。
（5）家族性腺瘤性息肉病：是一种常染色体显形遗传性疾病，大肠内布满息肉状腺瘤，大小不等，可有蒂或无蒂，具有很高的癌变倾向，多在12岁以后发生。
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